نظر استاد راهنما برای چاپ در پژوهش نامه دانشگاه مناسب است تاریخ و امضاء:
مناسب نیست
فهرست مطالب ج
عنوان صفحه
فصل اول: مقدمه و معرفی
۱.۱ مقدمه ۲
۱.۲ بیان مساله ۴
۱.۳ اهمیت موضوع تحقیق و انگیزه انتخاب آن ۶
۱.۴ هدف‌های تحقیق ۷
۱.۴.۱ هدف کلی ۷
۱.۴.۲ اهداف اختصاصی ۸
۱.۵ سوالات یا فرضیه‌‌های تحقیق ۸
۱.۶ تعاریف مفهومی ۸
فصل دوم: مبانی نظری و پیشینه تحقیق
۲.۱تعریف و مفهوم اوقات فراغت و دیدگاه‌های مختلف ۱۵
۲.۲ شاخص‌های فراغت در دوران جدید ۱۶
۲.۳ رویکردهای مختلف در تعریف اوقات فراغت ۱۷
۲.۴ اوقات فراغت از دیدگاه مکاتب فلسفی ۱۹
۲.۵ آراء چند‌تن از فلاسفه در خصوص اوقات فراغت ۱۹
۲.۶ نظریه‌های فراغت ۲۰
۲.۶.۱ دیدگاه دو‌مازیه ۲۰
۲.۶.۲ دیدگاه ادگینتون ۲۰
۲.۷ نظریه‌های مربوط به سلامت اجتماعی ۲۱
۲.۷.۱ رویکرد سیستمی ۲۱
۲.۷.۲ رویکرد اکولوژیکی ۲۱
۲.۸ اوقات فراغت و ساختار فعالیت‌ها ۲۱

رازی، عبدالله ( ۱۳۶۹ ). تاریخ کامل ایران. تهران : اقبال.
رحیمی، مهدی ( ۱۳۸۶ ). برگزیدگان. تهران : بعثت.
رستمیان، محمد علی ( ۱۳۸۱ ). حاکمیت سیاسی معصومان (ع). قم : دبیرخانه مجلس خبرگان.
رضوی اردکانی، ابوفاضل ( ۱۳۸۹ ). قیام یحیی بن زید. تهران : بین الملل.
ـــــــــــــــــــــــــ (۱۳۷۵).ماهیت قیام شهید فخ. قم: تبلیغات حوزه علمیه قم.
ـــــــــــــــــــــــــ (۱۳۸۴). شخصیت و قیام زید بن علی.قم:اسلامی.
زرگری نژاد، غلامحسین ( ۱۳۷۸ ). تاریخ صدر اسلام. تهران : سمت.
زرین کوب، عبدالحسین ( ۱۳۶۸ ). تاریخ ایران بعد از اسلام. تهران: امیر کبیر.
ـــــــــــــــــــــــــ ( ۱۳۶۸ ).تاریخ مردم ایران از پایان ساسانیان تا پایان آل بویه. تهران : امیر کبیر.
زین عاملی، محمد حسین ( ۱۳۸۹ ). شیعه در تاریخ. ترجمه محمد رضا عطایی، مشهد : آستان قدس رضوی.
سبط، موسی ( ۱۳۶۹ ). شیعه در اسلام. تهران : چهلستون.
سبحانی، جعفر ( ۱۳۹۰ ). فروغ ولایت. قم : موسسه امام صادق (ع).
شجاع شفیعی، محمد مهدی ( ۱۳۷۷ ). تاریخ هزار ساله اسلام در نواحی شمالی ایران. تهران : اشاره.
شریف القرشی، باقر ( ۱۳۶۸ ). تحلیلی از زندگانی امام موسی کاظم (ع). ترجمه محمدرضا عطایی، قم : کنگره جهانی حضرت رضا (ع).
ــــــــــــــــــــ ( ۱۳۸۷ ). این است شیعه. ترجمه محمود صالحی، تهران : عصر موعود.
شهرستانی، محمد بن عبدالکریم ( ۱۳۶۱ ). ملل و نحل. ترجمه محمدرضا جلالی نائینی، تهران : اقبال.
شهیدی، جعفر ( ۱۳۸۹ ). زندگانی امام صادق جعفر بن محمد. تهران : فرهنگ اسلامی.
ــــــــــــــــ ( ۱۳۸۸ ). تاریخ تحلیلی اسلام. تهران : علمی و فرهنگی.
صالحی، محمد ( ۱۳۸۴ ). سیری در زندگانی امام جعفر صادق (ع). تهران : معیار اندیشه.
ــــــــــــــــ ( ۱۳۸۴ ). سیری در زندگانی امام موسی کاظم (ع). تهران : معیار اندیشه.
صالحی نجف آبادی، نعمت الله ( ۱۳۸۴ ). غلو درآمدی بر افکار و عقاید غالیان در دین. تهران : کویر.
صفایی حائری، علی ( ۱۳۸۸ ). درس هایی از انقلاب تقیه. قم : لیله القدر.
طارمی، مهدی ( ۱۳۴۲ ). ره آوردهای استعمار. قم : فرهانی.
طباطبایی، محمد حسین ( ۱۳۶۰ ). ظهور شیعه. بی جا : فقیه.
ــــــــــــــــــــــــــ( ۱۳۶۰ ). شیعه در اسلام. قم : علمی و فکری علامه طباطبایی.
طبری، محمد بن جریر ( ۱۳۸۵ ). تاریخ الرسل والملوک. ترجمه ابوالقاسم پاینده، تهران : اساطیر.
طقوش، محمد سهیل ( ۱۳۸۷ ). دولت عباسیان. ترجمه حجت الله جودکی، قم : حوزه و دانشگاه.
عبدوس، محمد ( ۱۳۸۸ ). امامان شیعه، قم : بوستان کتاب.
عسگری، مرتضی ( ۱۳۸۹ ). نقش ائمه در احیای دین. قم : علمی و فرهنگی علامه عسگری.
علی، امیر ( ۱۳۶۶ ). تاریخ عرب و اسلام. ترجمه فخر دایی گیلانی، تهران : گنجینه.
علیدوست خراسانی، نورالله ( ۱۳۷۸ ). پرتوی از زندگانی امام صادق (ع). تهران : فرهنگ اسلامی.
عمید زنجانی، عباسعلی ( ۱۳۶۹ ). انقلاب اسلامی و ریشه های آن. تهران : کتاب سیاسی.
غیاثی کرمانی، محمد رضا ( ۱۳۷۴ ). اختران هدایت. کرمان : ندای حق.
فاضل، جواد ( بی تا ). معصوم پنجم و ششم (ع). تهران : کتب ایران.
فرای، ر.ن ( ۱۳۶۳ ). تاریخ ایران از اسلام تا سلاجقه. ترجمه حسن انوشه، تهران : امیر کبیر.
فیاض، علی اکبر ( ۱۳۹۰ ). تاریخ اسلام. تهران : دانشگاه تهران.
قائمی، علی ( ۱۳۷۷ ). در مکتب احیاگر تشیع حضرت امام جعفر (ع). قم : امیری.
قانعی، سعید ( ۱۳۷۹ ). زندگانی چهارده معصوم (ع). تهران : نغمه.
قمی، عباس ( ۱۳۸۳ ). منتهی آلامال. تهران : بوستان توحید.
کاظمی پوران، محمد ( ۱۳۸۰ ). قیام های شیعه در عصر عباسی. تهران : وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی.
کرون، پاتریشیا ( ۱۳۸۹ ). تاریخ اندیشه سیاسی در اسلام. ترجمه مسعود جعفری، تهران : سخن.
کریمان، حسین ( ۱۳۸۲ ). سیره و قیام زید بن علی. تهران : علمی و فرهنگی.
کلینی، محمد ( ۱۳۸۸ ). اصول کافی. ترجمه لطیف راشدی، قم : اجود.
کوشا، محمد علی ( ۱۳۷۸ ). سیره و سخن پیشوایان. قم : پارسایان.
لاپیدوس، ایراام ( ۱۳۸۷ ). تاریخ جوامع اسلامی. ترجمه علی بختیاری زاده، تهران : اطلاعات.
لسترنج، گای ( ۱۳۷۷ ). جغرافیای تاریخی سرزمین های خلافت شرقی. ترجمه محمود عرفان، تهران : علمی و فرهنگی.
مجلسی، محمدباقر ( ۱۴۰۳ ق ). بحارالانوار. بیروت : الوفاء.
مجهول المولف (۱۳۸۹) . گزیده ای از تاریخ تشیع . قم: سبحان.
محرمی، غلامحسین ( ۱۳۸۶ ). تاریخ تشیع. قم : هاجر.
محمدی، علی ( ۱۳۸۶ ). شرح کشف المراد. تهران : دارالفکر.
محمدی ری شهری، محمد ( ۱۳۷۶ ). رهبری در اسلام. قم : دارالحدیث.

شکل ۴-۲ نمودار تغییرات ماتریس سختی  بر حسب نیروی محوری
شکل۴-۳ نمودار تغییرات سختی  بر حسب نیروی محوری
شکل ۴-۴ نمودار تغییرات سختی  بر حسب نیروی محوری
شکل ۴-۵ نمودار تغییرات سختی  بر حسب نیروی محوری
که در نمودار منظور از k_txtx همان  می­باشد. همچنین لازم به ذکر است که مقادیر  منفی هستند و در نمودار اندازه­ این مقادیر آورده شده است.
شکل۴-۶ نمودار تغییرات سختی  بر حسب نیروی محوری
۴-۴- بررسی اثر پیش بار بر المان های ماتریس سختی
در این بخش به بررسی اثر پیشبار بر روی ماتریس سختی پرداخته می­ شود. مشابه آنچه که گفته شد از پارامترهای جدول ۳-۱ استفاده شده است. پیشبار را ۱ کیلو نیوتن قرار داده و مقادیر  ،  ،  ،  را محاسبه می­کنیم. پیشبار را در هر مرحله ۱ کیلو نیوتن افزایش می­دهیم و اثر آن را بر اندازه­ سختی بررسی می­کنیم.
شکل۴-۷ نمودار تغییرات سختی  با تغییرات پیشبار
شکل۴-۸ نمودار تغییرات سختی  با تغییرات پیشبار
شکل۴-۹ نمودار تغییرات سختی  با تغییرات پیشبار
شکل ۴-۱۰ نمودار تغییرات سختی  با تغییرات پیشبار
شکل ۴-۱۱ نمودار تغییرات سختی  با تغییرات پیشبار
همانطور که مشاهده شد با افزایش پیشبار اندازه المانهای ماتریس سختی نیز افزایش می­یاشد. این امر به این دلیل است که افزایش پیشبار منجر به افزایش جابجایی المانهای بلبرینگ می­ شود و در نتیجه با افزایش مقادیر بردار جابجایی، مقادیر درایه­های ماتریس سختی نیز افزایش می­یابد چراکه مستقیماً به بردار جابجایی وابسته است.
۴-۵- بررسی اثر پیش بار بر خصوصیت ارتعاشی سیستم
در این بخش به بررسی اثر نیروی پیشبار بر خصوصیت ارتعاشی سیستم پرداخته می­ شود. بلبرینگ مورد نظر خواص ذکر شده در جدول ۳-۱ را دارد و برای این پژوهش مقادیر جرم و میرایی مذکور در فصل گذشته در نظر گرفته شده است. در این بخش به بررسی تغییرات فرکانس طبیعی با تغییرات پیشبار می­پردازیم.

( اینجا فقط تکه ای از متن پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

فرض می­ شود که میرایی مقادیر ذکر شده در فصل گذشته را دارد. لذا برای محاسبه­ی فرکانس نیاز به حل معادله­ ۳-۲۰ می­باشد. با محاسبه­ی ماتریسهای معلوم نیاز است که مقادیر ویژه­ی^[۵۱] معادله­ مذکور محاسبه شود. نتایج حاصل از این محاسبات برای چیدمان پشت به پشت بلبرینگ می­باشد.
شکل ۴-۱۲ اثر نیروی پیشبار بر فرکانس طبیعی مد اول سیستم
فصل پنجم
نتیجه گیری و پیشنهاد ادامه کار
۵-۱- مقدمه
در این پژوهش به بررسی ماتریس سختی و اثر پیش­بار بر خصوصیت ارتعاشی سیستم و همچنین اثر آن بر ماتریس سختی بلبرینگ تماس زاویه­ای دو ردیفه پرداخته شده است.با محاسبه بارهای وارده و تغییرمکان(جابجایی) ایجاد شده در یاتاقان، ماتریس سختی بلبرینگ تماس زاویه­ای دو ردیفه محاسبه شد. سپس با نوشتن معادلات حاکم بر ارتعاش آزاد مستقیم، فرکانس­های طبیعی محاسبه گردید. سپس با معلوم بودن مقادیر بردار نیرو به محاسبه­ی بردار جا به ­جایی با بهره گرفتن از تکنیکهای محاسبات عددی برای حل معادلات غیر خطی در نرم افزار متلب با بهرگیری از روش سکانت پرداخته شد و سپس نتایج آنها ارائه گردید.
۵-۲- نتایج
با بررسی تغییرات نیروی شعاعی  بر ماتریس سختی مشاهده می­ شود که تغییرات محسوسی بر المانهای ماتریس سختی ایجاد می­ شود. ملاحظه می­گردد که با افزایش نیروی شعاعی المانهای ماتریس سختی افزایش می­یابند. مشاهده می­گردد که  با افزایش چشم گیری مواجه شده و تا ۱۳۰ کیلونیوتن بر میلیمتر می­رسد. همچنین مشاهده می­گردد که با افزایش نیرو، افزایش تغییرات  نسبت به  و  بیشتر می­ شود. مشاهده گردید که با افزایش نیرو از ۱ کیلونیوتن به ۱۰ کیلونیوتن، مقدار  به بیش از ۵ برابر افزایش می­یابد. دلیل افزایش مقادیر به دلیل تاثیر پذیری مستقیم مقادیر درایه­های ماتریس سختی از مقادیر بردار جابجایی المانهای بلبرینگ است که با تغییرات نیرو تغییر می­ کنند.
مقادیر  نیز با افزایش بار شعاعی زیاد شده و در ابتدا به ازای نیروی ۱ کیلونیوتن بار شعاعی مقدار حدود ۲۰ کیلونیوتن بر میلیمتر را دارد و با افزایش بار به تدریج افزایش می­یابد و در نهایت حدود ۴ برابر می­ شود. مقادیر  نیز به تدریج افزایش یافته و به حدود ۳ برابر می­رسد.
مقادیر  و  نیز با افزایش نیروی شعاعی افزایش می­یابد اما تغییرات  به مراتب بیشتر از مقادیر  می­باشد. که علت اتفاق این امر به دلیل وجود جمله­ کسینوسی در  می­باشد که زاویه­ی آن با توجه به نحوه­ قرارگیری ساچمه­ها در این پژوهش به گونه ­ای است که جمله­ کسینوسی مقادیر بیشتری را نسبت به جمله­ سینوسی در  به خود می­گیرد.
نتایج حاصل از بررسی اثر پیشبار بیانگر این امر می­باشد که با افزایش پیشبار اندازه­ المانهای ماتریس سختی نیز افزایش می­یابد. با افزایش پیشبار از ۱ تا ۱۰ کیلونیوتن،  با افزایش ۱٫۵ برابری مواجه شده است. تغییرات  نیز همانند  می­باشد.  افزایش ۳ برابری داشته­ است و اندازه­  به بیش از ۶ برابر افزایش یافته است. مقادیر  نیز افزایشی ۴ برابری داشته است.
با بررسی ارتعاشی سیستم و مشاهده­ اثر تغییرات پیشبار بر فرکانس طبیعی، مشاهده گردید که با افزایش پیشبار فرکانس طبیعی سیستم نیز به تدریج افزایش می­یابد.
علت این امر این است که با افزایش پیشبار، سختی سیستم بررسی شده افزایش یافته که خود منجر به افزایش فرکانس طبیعی می­ شود که منجر به افزایش پایداری می­ شود زیرا با افزایش فرکانس طبیعی، تشدید در فرکانسهای بالاتری رخ می­دهد.
۵-۳- پیشنهاد ادامه کار
در پژوهشهای آتی می­توان به بررسی اثر زاویه تماس باربرداری شده^[۵۲] بر المانهای ماتریس سختی پرداخت چرا که زاویه­ی تماس مستقیماً بر ماتریس سختی اثر می­گذارد لذا با بررسی تغییرات آن می­توان نحوه­ اثر زاویه­ی تماس را بر ماتریس سختی مشاهده کرد.
همچنین پیشنهاد می­گردد که اثر تعداد ساچمه­های بلبرینگ مورد بررسی قرار گیرد و اثر تغییرات آن بر ماتریس سختی و خصوصیات ارتعاشی سیستم مورد بررسی قرار گیرد. تعداد ساچمه­ها از پارامترهای مهم و مؤثر بر ماتریس سختی می­باشد چراکه بر تحمل بار و خصوصیات ارتعاشی سیستم تأثیر می­گذارد.
از دیگر مواردی که می­توان به آن اشاره کرد این است که به بررسی ماتریس سختی و اثر پیشبار بر خصوصیات ارتعاشی بلبرینگ استوانه­­ای پرداخته شود. این نوع بلبرینگها نیز از جمله بلبرینگهای پرکاربرد می­باشند که در نحوه­ تحمل بار با بلبرینگهای ساچمه­ای تفاوت دارند.
مراجع

1. 1. Y. Kang, C.-C. Huang, C.-S. Lin, P.-C. Shen, Y.-P. Chang, Stiffness determination of angular-contact ball bearings by using neural network, Tribology International, Vol. 39, pp. 461–۴۶۹, ۲۰۰۶٫

1. 1. Y. Kang, C.-C. Huang, C.-S. Lin, P.-C. Shen, Y.-P. Chang, A modification of the Jones– Harris method for deep-groove ball bearings, Tribology International, Vol. 39, pp. 1413–۱۴۲۰, ۲۰۰۶٫

1. 1. C.-M. Lin., Analysis for the Stiffness of Ball Bearings, Master’s thesis, Chung Yuan Christian University, Department of Mechanical Engineering, 2002.

1. 1. A. H. Tedric, N.K. Michael, Rolling bearing analysis: Essential Concepts of Bearing Technology, Fifth Edition, Taylor & Francis Group, ISBN: 0-8493-7183-X, 2007.

1. 1. A. H. Tedric, Rolling bearing analysis, Fourth edition, John Wiley & Sons, Inc, ISBN: 0-471-35457-0, 2001.

1. 1. L. Houpert., A Uniform Analytical Approach for Ball and Roller Bearings Calculations, ASME J. Tribology International., 119, pp. 851 – ۸۵۸, ۱۹۹۷٫

1. 1. B. J. Hamrock, D. Dowson, Isothermal elastohydrodynamic lubrication of point contacts—part I: theoretical formulation, Journal of Lubrication Technology, vol. 98, no. 2, pp. 223–۲۲۹, ۱۹۷۶٫

1. 1. B. J. Hamrock, Fundamentals of Fluid Film Lubrication, McGraw-Hill, New York, NY, USA, 1994.

1. 1. D. E. Brewe, B. J. Hamrock, Simplified solution for elliptical-contact deformation between two elastic solids, Journal of Lubrication Technology, vol. 99, no. 4, pp. 485–۴۸۷, ۱۹۷۷٫

1. 1. T.A. Harris, Rolling Bearing Analysis, J. Wiley, New York, 2001.

1. T. J. Royston, I. Basdogan, Vibration transmission through self-aligning (spherical) rolling element bearings: theory and experiment, Journal of Sound and Vibration, vol. 215, pp.997–۱۰۱۴, ۱۹۹۸٫

ابتدا به مدت سه دقیقه با نیمی از محلول A ژل را بر روی shaker شستشو می دهیم. بعد از مدت مورد نظر محلول را خالی کرده وبا بقیه محلول A به مدت سه دقیقه شستشو را ادامه می دهیم. سپس محلول را خالی می کنیم.
محلول B را به طور کامل به ظرف رنگ آمیزی منتقل کرده و به مدت ۱۵ دقیقه بر روی Shaker رنگ آمیزی می کنیم. پس از مدت مورد نظر محلول را خالی کرده و ژل را در آب مقطر شستشو می دهیم.
حالا محلول C را اضافه می کنیم و ظرف را آن قدر روی Shaker قرار می دهیم تا باند های DNA ظاهر شود. پس از رنگ آمیزی محلول را خالی کرده و رنگ آمیزی نیترات نقره را با اضافه کردن آب مقطر متوقف می کنیم.
۳-۴-۵-۴-۳ بررسی ژل های پلی آکریل آمید (Homozygosity Mapping)
مارکرهای STR دارای الگوی توارث مندلی می باشند و می توان بدین منظور الگوی توارث ۲ آلل یک جایگاه ژنی را از پدر و مادر به فرزندان ردیابی کرد.
در روش Homozygosity Mapping به دلیل این که در مورد بیماری های مغلوب کاربرد دارند، در صورتی که ژن موجود در جایگاه ژنی مورد بررسی عامل بیماری باشند، به دلیل به ارث بردن آلل مشترک از جد مشترک، فرد بیمار برای آن آلل مورد نظر باید هموزیگوت باشد. بنابراین در بررسی به وسیله مارکرها فقط یک باند قابل رویت است.

( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

برای پی بردن به وجود جهش در لوکوس های مورد نظر، در ابتدا ۳ مارکر که دارای هتروزیگوسیتی بالایی در جمعیت ایران بود و نسبت به مارکرهای دیگر نزدیک ترین فاصله را به ژن موردنظر داشتند، انتخاب شدند و برای هر خانواده پدر، مادر، فرزندان بیمار و یک فرزند سالم مورد بررسی آنالیز پیوستگی قرار گرفتند. در صورتی که این مارکرها در خانواده موردنظر informative نبودند و یا جواب آن ها مثبت بود،پیوسته به ژن مورد نظر بودند یعنی افراد بیمار در روی ژل پلی آکریل آمید فقط یک باند داشتند و افراد سالم یک و یا دو باند داشتند، برای پیدا کردن جهش به روش مستقیم تعیین توالی آماده می شدند
۳-۴-۶ پیدا کردن جهش به روش مستقیم تعیین توالی
به کمک روش آنالیز پیوستگی فقط می توان به طور غیر مستقیم به وجود جهش در ژن موردنظر پی برد. برای تایید وجود جهش و تعیین نوع و جایگاه جهش، از روش مستقیم تعیین توالی^[۶۳] استفاده کردیم.
Sequencing به دو روش انجام می شود:
روش آنزیمی که به روش Gilbert معروف است.
روش شیمیایی که به روش Sanger معروف است. امروزه تعیین توالی به روش سنگر، بیشترین کاربرد را در تجزیه و تحلیل توالی DNA دارد.
اصول کلی هر دو روش تعیین توالی، قطعه قطعه کردن رشته DNA به چهار سری از قطعات نشاندار می باشد. واکنش تولید کننده هر کدام از این سری ها دارای ویژگی بازی بوده و بنابراین طول قطعات DNA حاصل بستگی به موقعیت های باز مورد نظر در داخل توالی DNA دارد.
تعیین توالی به روش سنگر، از آنالوگ های شیمیایی نوکلئوتیدها برای مهار آنزیم DNA پلیمراز به هنگام ساخت رشته مکمل رشته الگو که باید توالی آن تعیین شود، بهره می برد. برای انجام توالی یابی، ساخت DNA با یک الیگونوکلئوتید کوتاه (پرایمر) آغاز شده و DNA پلیمراز در طول توالی رشته الگو پیش رفته و طول پرایمر را گسترش و نوکلئوتیدهای دارای نشان رادیواکتیو یا نوکلئوتیدهای حامل برچسب فلورسانت را در داخل توالی نوساخته جای می دهد[۸۶]. با اضافه کردن یکی از آنالوگ های مهاری همراه با هر چهار نوکلئوتید طبیعی به هر یک از چهار واکنش تعیین توالی، می توان اطلاعاتی درباره توالی نوکلئوتیدی به دست آورد، زیرا وقتی DNA پلیمراز این آنالوگ را جای دهد، گسترش درصدی از مولکول های DNA متوقف خواهد شد. مقادیر نسبی نوکلئوتیدهای طبیعی و آنالوگ آن ها به یکدیگر طوری تنظیم شده که رشته هایی با طول‌های مختلف ساخته شود. وقتی این نمونه بعداً توسط الکتروفورز در ژل تجزیه و تحلیل شد تعدادی نوار با طول های منطبق بر محل هر یک از واحدهای نوکلئوتیدی مشاهده می شود. این کار در هر دو جهت انجام می شود و سپس نتایج حاصله توسط نرم افزارهای مربوطه مورد آنالیز قرار می گیرد.
در این جا برای نمونه چگونگی تعیین توالی ژن GJB4 شرح داده می شود:
ابتدا توالی مرجع ژن GJB4 را از وب سایت بیوانفورماتیکی UCSC Genome یافتیم [۸۲].
دو جفت پرایمر به کمک وب سایت UCSC (exon primer) و Primer3 طوری طراحی شد که کل قاب خواندنی این ژن که دارای ۲ اگزون می باشد را در برگیرد. این پرایمرها طوری طراحی شدند که تمام نواحی اتصال اینترون و اگزون را هم در برگیرند[۸۸,۸۹].
چون پرایمرها با هدف انجام تعیین توالی طراحی شدند، طوری انتخاب شده بود که حدود ۳۰-۲۰ نوکلئوتید داخل اینترون باشند چون نتایج حاصل از تعیین توالی در ۳۰-۲۰ نوکلئوتید اول قابل خواندن نیست.
درواکنش PCR پرایمرها به دو طرف توالی هدف اتصال می یابند و امکان شروع فعالیت پلیمرازی آنزیم DNA پلیمراز را فراهم می آورند. بنابراین اولین خصوصیت پرایمر، توالی صحیح آن جهت جفت شدن با محل مورد نظر DNA برای تکثیر است. برای طراحی پرایمرها باید به موارد زیر توجه کرد:
طول پرایمر بین ۱۷ تا۳۰ باز باشد.
پرایمرها توزیع یکنواختی از توالی های غنی از A/T و G/C داشته باشند.
انتهای ´۳ آغازگرهای به کاررفته در یک واکنش نباید با یکدیگر مکمل باشند. در غیر این صورت تشکیل دایمرهای الیگونوکلئوتید می دهند که باعث کاهش عملکرد واکنش می گردد.
پرایمرها دارای توالی تکراری در طول ژنوم نبا
شند که موجب تکثیر نابجای قطعه ی دیگری به جای قطعه مورد نظر شود.
سپسDNA یکی از افراد مبتلا خانواده هایی که طبق نتایج حاصله از آنالیز پیوستگی به ژن GJB4 پیوستگی داشتند انتخاب شدند و با هر ۲ جفت پرایمر تکثیر شدند.
تکثیر قطعات مورد نظر طی واکنش PCR انجام می شود. سپس برای اطمینان از تکثیر DNA و مناسب بودن کیفیت محصولات PCR جهت تعیین توالی، محصولات PCR را بسته به طول قطعه، بر روی ژل آکریل آمید ۸ درصد و یا آگارز ۲% run می کنیم.
۳-۴-۶-۱ الکتروفورز محصولات PCR بر روی ژل آگارز
الکتروفورز روی ژل آگارز روشی استاندارد جهت جدا سازی، تشخیص و تخلیص قطعات DNA است. همان طور که درجدول زیر نشان داده شده است، درصد ژل آگارز به طول قطعات DNA بستگی دارد.
۳-۴-۶-۱-۱ مواد لازم جهت انجام الکتروفورزDNA برروی ژل آگارز
بافر TAE
این بافر معمولاً با غلظت ۵۰ برابر (x50) تهیه و در دمای اتاق نگهداری می شود. هنگام کار باید رقیق گردد TAE lX)).
Tirs-base gr 242
اسیداستیک گلاسیال .ml 1/57
M5/0 EDTA (8 pH) ml100
آب مقطر با حجم ml1000
بافر بارگذاری^[۶۴] سایبرگرین
رنگ های SYBER در DMSO ذخیره و نگهداری می شوند. این بافر با غلظت ۱۰X تهیه و در فریزر نگهداری می شود و با رقت ۱:۱۰۰۰ مورد استفاده قرار می گیرد. بهتر است که با رقت متوسط ۱:۱۰۰ در فریزر نگهداری شود.
جدول ۳-۱۴ مواد سازنده بافر بارگذاری

۲۸

۲/۹

۵/۲۰

۰/۷

۵/۳

اسفند

۴۲

۷/۱۲

۷/۲۴

۸/۶

۱/۵

فروردین

۱۵

۴/۱۸

۴/۳۲

۰/۸

۴/۸

اردیبهشت

۲

۸/۲۳

۵/۳۹

۳/۹

۴/۱۲

۳-۲-۱ معرفی مدل AquaCrop
شناخت روابط حاکم بین گیاه، خاک و محیط در هر منطقه مستلزم اجرای آزمایشات متعدد در آن منطقه است که نیازمند صرف هزینه، زمان و نیروی انسانی فراوان است. به­منظور رفع این مشکل سازمان خواروبار جهانی اخیراً یک مدل شبیه­ساز به نام AquaCrop ساخته است که به عنوان یک ابزار می ­تواند محققان و کارشناسان ذیربط را در تصمیم­سازی و تصمیم ­گیری اجرای مدیریت کم آبیاری تحت شرایط خاکی، اقلیمی و مدیریتی مختلف کمک نموده و راهبردهای مدیریت مزرعه که می­توانند بر مدیریت کم آبیاری مؤثر باشد را مورد ارزیابی قرار داده و در نهایت مدیریت بهینه کم آبیاری را متناسب با هر اقلیم تعیین ­نماید. با توجه به اینکه مدل AquaCrop یک مدل جهانی است، ارزیابی و بومی­سازی آن قبل از کاربرد ضروری است. ارزیابی این مدل مستلزم اجرای آزمایشات مزرعه­ای با سطوح مختلف آبیاری است تا با اطلاعات و داده ­های حاصل از این آزمایشات، مدل واسنجی و ارزیابی گردیده و بعد از تأیید کارکرد آن با اطمینان خاطر بتوان مدل را برای اهداف مورد نظر در مناطق مختلف اجراء و بر اساس نتایج خروجی مدل تصمیم ­گیری نمود.

(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))

در این مدل، گیاه از طریق توسعه یک سایه­انداز سبز که آب را تعرق می نماید و یک سیستم ریشه­ای که آب را جذب می­نماید رشد می­ کند. ماده خشک تولید شده متناسب با آب تعرق شده است. در یک مرحله نموی خاص، بخشی از ماده خشک تولید شده از طریق شاخص برداشت (HI) به اجزاء عملکرد تخصیص داده می­ شود. ساختار کلی AquaCrop در شکل ۳-۱۰ نشان داده شده است (ریس و همکاران، ۲۰۰۹). در طی چرخه زندگی گیاه زراعی، مقدار آب ذخیره شده در ناحیه ریشه از طریق بودجه­بندی آب ورودی (بارندگی و آبیاری) و آب خروجی (رواناب، تبخیر و تعرق، نفوذ عمقی) شبیه­سازی می­ شود. تخلیه آب در ناحیه ریشه، میزان ضرایب تنش آب (Ks) را که بر ۱- توسعه سایه­انداز سبز (CC)، ۲- هدایت روزنه­ای و تعرق در هر واحد سایه­انداز، ۳- زوال و کاهش سایه­انداز، ۴- شاخص برداشت موثر می­باشد را تعیین می­نماید. هر یک از این فرایندها نسبت به تنش آب، دارای آستانه تخلیه رطوبتی و منحنی­های (توابع) پاسخ خاص مربوط به خودشان می­باشند. بعلاوه سرعت نفوذ و توسعه ریشه تابعی از ضریب تنش هدایت روزنه­ای است. در صورتی که تنش رطوبتی حادث گردد، سایه­انداز شبیه­سازی شده کمتر از سایه انداز پتانسیل (CC_pot) تحت شرایط بدون تنش است. ضریب تعرق (Kc_tr) متناسب با سایه­انداز گیاه است و به­ طور مداوم در طی شبیه­سازی تنظیم می­گردد. ماده خشک اندامهای هوایی (B) از تعرق و کارایی آب نرمال شده (WP^*، یک پارامتر گیاهی نسبتاً ثابت است) مشتق می­ شود . در پایان چرخه زندگی گیاه، عملکرد به صورت حاصل­ضرب ماده خشک اندام­هایی (B) در شاخص برداشت تنظیم شده (HI) محاسبه می­گردد (استدیوتو و همکاران، ۲۰۰۹: ریس و همکاران، ۲۰۰۹).
معادله ۳-۲ : wp=
معادله ۳-۳: HI=
در روابط (۳-۲) و (۳-۳)، Yield و Biomass بر اساس کیلوگرم و آب مصرفی بر حسب متر مکعب است.
با واسنجی مدل برای شرایط تنش محدودیت عناصر غذایی (حاصلخیزی خاک) و تنش شوری می­توان تأثیر این تنش­ها را بر رشد و عملکرد گیاه نیز شبیه سازی نمود.

شکل ۳-۱۰ ساختار محاسباتی AquaCrop ، خطوط نقطه چین (a تا e ) نشان دهنده فرایندهایی است که تحت تاثیر تنش خشکی قرار میگیرند. CC^* پوشش سایه­انداز گیاه تعدیل شده، CC_pot پوشش پتانسیل سایه­انداز، Ks ضریب تنش (برای هر فرایند متفاوت است)،HI شاخص برداشت، Kc_tr ضریب تعرق گیاهی، WP^* کارایی مصرف آب نرمال شده برای ET₀ و غلظت CO₂ ، ET₀ تبخیر و تعرق مرجع است (ریس و همکاران، ۲۰۰۹).
۳-۲-۲ توصیف مدلAquaCrop
مدل AquaCrop نیز مانند مانند CROPWAT و Budget از معادله دورنبوس و کسام که در نشریه ۳۳ فائو برای محاسبه ضریب حساسیت کم آبی بر اساس تعیین نسبت تبخیر و تعرق (ET) و عملکرد نسبی بیان شده است استفاده می­ کند و هر سه مدل بر اساس معادله بیلان آب عمل می­ کنند (ریس و همکاران، ۲۰۰۹؛ استدیوتو و همکاران، ۲۰۰۹).
معادله ۳-۴: ) =ky(
در این معادله Y_x عملکرد حداکثر، Y_a عملکرد واقعی، ET_x تبخیر و تعرق حداکثر، Et_a تبخیر و تعرق واقعی و K_y ضریب تناسب بین کاهش عملکرد نسبی و کاهش نسبی تبخیر و تعرق است. مدل AquaCrop با تفکیک تبخیر- تعرق (ET) به تعرق از سطح گیاه (T_r) و تبخیر از سطح خاک (E) و همچنین توسعه یک مدل ساده رشد و پیری کانوپی گیاه به­عنوان پایه برآورد تعرق از سطح گیاه و تفکیک آن از تبخیر، شبیه­سازی عملکرد نهایی محصول به­عنوان تابعی از عملکرد بیولوژیک محصول (B) و شاخص برداشت (HI) و همچنین تفکیک اثر تنش آبی در چهار بخش: رشد پوشش تاجی، پیری پوشش تاجی گیاه، تعرق از سطح گیاه و شاخص برداشت محصول توسعه یافته است. با تفکیک تبخیر و تعرق به تعرق از سطح گیاه و تبخیر از سطح خاک می­توان از اثر مصرف غیر تولیدی آب از طریق تبخیر از سطح خاک به­ ویژه در شرایط پوشش گیاهی ناکامل جلوگیری کرد. تعرق روزانه با بهره گرفتن از نیاز تبخیری و غلظت CO₂ اتمسفر نرمال شده به عملکرد بیولوژیک گیاه تبدیل می­ شود و بر اساس معادله زیر قابل محاسبه است (استدیوتو و همکاران، ۲۰۰۷،۲۰۰۹).
معادله ۳-۵: ) Bi=WP×(
که در این رابطه WP^* بهره­وری آب که با نرمال کردن مناسب برای شرایط اقلیمی متفاوت مقدار آن به یک پارامتر ثابت تبدیل می­ شود، B_i (زیست توده نهایی) عملکرد بیولوژیک، T_ri تعرق روزانه و ET_oi تیخیر و تعرق روزانه است. بنابراین گام گذاشتن از معادله ۳-۴ به معادله ۳-۵ دلالت بر صحت و عمومیت مدل دارد. برتری دیگر معادله مورد استفاده در مدل AquaCrop (معادله ۳-۵) نسبت به معادله (۳-۴) این است که شبیه­سازی فرآیندهای رشد گیاه در آن با بهره گرفتن از گام­های زمانی روزانه صورت می­گیرد، در حالی­که در معادله ۳-۴ به­ صورت ماهانه یا فصلی انجام می­ شود. در تمام دوره رشد گیاه، مقدار آب ذخیره شده در ناحیه ریشه از طریق بیلان آبی جریان آب ورودی (آبیاری و بارندگی) و خروجی (رواناب، نفوذ عمقی و تبخیر و تعرق) در ناحیه ریشه شبیه­سازی می­ شود. شدت ضرایب تنش آبی (k_S) مؤثر بر توسعه پوشش تاجی (CC)، هدایت روزنه­ای تعرق (شدت تعرق در واحد CC)، پیری و کاهش پوشش تاجی و شاخص برداشت به وسیله کسر تخلیه آب در ناحیه ریشه تعیین می­ شود. به­علاوه بعضی جنبه­ های مدیریتی و عملکرد نهایی با تاکید بر آبیاری، سطوح حاصلخیزی خاک از طریق تاثیرات آنها بر توسعه رشد گیاه، بهره­وری آب و تعدیل محصول به تنش­ها بیان می­ شود. در پایان مقدار عملکرد محصول با بهره گرفتن از جرم قسمت پوشش هوایی گیاهی شبیه­سازی شده و شاخص برداشت (HI) تعدیل شده محاسبه می­گردد. در این مدل تأثیر تنش شوری و آفات و بیماری­ها لحاظ نشده است (مارینیو و همکاران، ۲۰۰۵؛ ریس ۲۰۰۲).
اگرچه مدل AcuaCrop بر مبنای فرآیندهای بیوفیزیکی پیچیده بنا نهاده شده است (استدیوتو و همکاران، ۲۰۰۹)، تعداد نسبتا کمی از پارامترهای ساده و قابل دسترس به­عنوان پارامترهای ورودی استفاده می­شوند. ورودی­های مدل شامل چهار دسته از اطلاعات یعنی: داده ­های اقلیمی، گیاهی، خاک و مدیریت مزرعه­ای هستند.
شکل ۳-۱۱ نمایش منوی اصلی مدلAquaCrop
۳-۲-۳ معرفی کلی نرم افزار ET0Calculator
کارکرد اصلی این نرم­افزار محاسبه تبخیر و تعرق مرجع بر اساس استانداردهای FAO است. خروجی­های این برنامه حاوی مقادیر تبخیر و تعرق به شکل ماهانه، ده­ روزه و یا روزانه است. سایر اطلاعات هواشناسی همراه با فایل­های خروجی این برنامه، در قالب فایل­های متنی در مدل AquaCrop مورد استفاده قرار می­گیرند. در شکل ۳-۱۲، نمایی از منوی اصلی نرم­افزار ET0Calculator مشاهده می­ شود.